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Recuperación de la microbiota intestinal de adultos sanos tras la exposición a antibióticos
Los antibióticos alteran la composición de la microbiota y aumentan la susceptibilidad a las infecciones. Sin embargo, los efectos generalizables de los antibióticos y la contribución de las variables ambientales a los comensales intestinales siguen sin estar claros. Para abordar esta cuestión, hemos seguido la dinámica de la microbiota con alta resolución temporal y taxonómica durante el tratamiento con antibióticos en un sistema murino controlado, aislando variables como la dieta, el historial de tratamiento y los cohabitantes de la vivienda. La microbiota humana fue notablemente resistente y se recuperó durante el tratamiento con antibióticos, con un dominio transitorio de Bacteroides resistentes y una reducción de la diversidad taxa-asimétrica. En algunos casos, las sensibilidades in vitro no predijeron las respuestas in vivo, lo que subraya la importancia del contexto del huésped y de la comunidad. Una dieta deficiente en fibra exacerbó el colapso de la microbiota y retrasó la recuperación. La sustitución de especies mediante el alojamiento cruzado tras el tratamiento con ciprofloxacina estableció la resistencia a un segundo tratamiento. El alojamiento individual alteró drásticamente la recuperación, lo que pone de manifiesto la importancia de los reservorios ambientales. Nuestros resultados ponen de manifiesto las adaptaciones deterministas de la microbiota a las perturbaciones y el potencial de traslación para modular la dieta, el saneamiento y la composición de la microbiota durante el tratamiento con antibióticos.
Reconstruir el ecosistema de la microbiota intestinal
El uso de antibióticos se ha relacionado durante mucho tiempo con la privación de bacterias intestinales, que son necesarias para ayudar a fortalecer el sistema inmunitario. Un estudio demuestra que la composición y la función de las bacterias intestinales pueden recuperarse en su mayor parte tras un tratamiento con antibióticos en personas sanas. Esto significa que somos capaces de regenerar nuestras bacterias intestinales y su entorno, lo que es importante para nuestra salud en general. Sin embargo, lo preocupante es la posibilidad de perder algunas de esas bacterias beneficiosas de forma permanente tras múltiples tratamientos con antibióticos a lo largo de nuestra vida. Por lo tanto, deberíamos intentar minimizar el número de tratamientos con antibióticos siempre que sea posible, tomando antibióticos sólo cuando sea absolutamente necesario. Más información sobre lo que puede hacer para prevenir la resistencia a los antibióticos.
Antibióticos probióticos
¿Ha pensado alguna vez en los antibióticos y la salud de los niños? A la mayoría de los niños se les prescribe al menos un tratamiento de antibióticos durante sus primeros años de vida. Por lo general, un tratamiento corto elimina rápidamente las infecciones bacterianas, y los niños se recuperan bien y rápidamente cuando los toman. Los antibióticos son convenientes, y esto también significa que la vida normal se reanuda bastante rápido cuando los niños los toman. Sin embargo, cada vez hay más pruebas de que la toma de antibióticos tiene efectos a largo plazo en la salud de nuestros hijos, y regularmente recibo mensajes de padres que me preguntan qué pueden hacer para contrarrestar los efectos negativos.
Cuando nuestros hijos toman antibióticos, corren el riesgo de sufrir efectos secundarios agudos, como malestar estomacal con diarrea, o incluso una reacción alérgica a los antibióticos, que por suerte suelen resolverse rápidamente. También pueden producirse infecciones por hongos durante o poco después del tratamiento, lo que puede dar lugar a un crecimiento excesivo de hongos en la boca, el intestino y el pubis, que puede ser desagradable y probablemente requiera un tratamiento adicional.
Diarrea por antibióticos
Comparamos los modelos 1 y 2 (Archivos Suplementarios 1 y 2). para cada grupo de tratamiento con antibióticos utilizando el factor de Bayes [50, 51] después de extraer los ajustes del modelo utilizando el muestreo puente con el paquete R bridgesampling v0.2-2 [52]. Un análisis de sensibilidad previa (no se muestra) mostró que la elección de los priores no afectó a nuestras conclusiones sobre la selección del modelo, aunque la fuerza del factor de Bayes varió.El código completo y los datos para el ajuste de los modelos y la reproducción de las figuras está disponible con este artículo (Archivos Suplementarios 1-5).Shotgun metagenomics datasetPara el ajuste del conjunto de datos publicado por Palleja et al. [27], utilizamos los datos de riqueza de especies publicados con un factor de escala arbitrario (véase el texto suplementario 1 para los detalles, el archivo suplementario 6 para el código y el archivo suplementario 7 para los datos descargados).Simulaciones Lotka-VolterraSimulamos numéricamente 59 = 1953125 conjuntos de parámetros del modelo GLV con n = 3 especies e investigamos su comportamiento y estados estables. Para más detalles, véase la discusión suplementaria correspondiente (Texto suplementario 2) y el cuaderno de Mathematica (Archivo suplementario 8).
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